在細(xì)菌全基因組測(cè)序（WGS）實(shí)驗(yàn)中，磁珠DNA純化是文庫(kù)制備的核心環(huán)節(jié)。傳統(tǒng)手工操作不僅耗時(shí)費(fèi)力、易引入人為誤差，還會(huì)限制樣本通量與實(shí)驗(yàn)穩(wěn)定性。如今，Hamilton Microlab PuriFY自動(dòng)化純化平臺(tái)帶來全新解決方案，適配NGS文庫(kù)制備流程，大幅提升實(shí)驗(yàn)效率與測(cè)序質(zhì)量！

一、痛點(diǎn)直擊：手工純化的諸多難題

下一代測(cè)序文庫(kù)制備包含多步磁珠純化流程，人工操作短板十分突出：

操作步驟繁瑣，全程占用大量人力；

多批次樣本處理時(shí)，人為失誤概率飆升；

磁珠殘留、操作不均等問題，間接影響下游測(cè)序結(jié)果；

吸頭等耗材消耗量大，實(shí)驗(yàn)成本居高不下。

為破解以上問題，本次聯(lián)合National Jewish Health開展對(duì)比實(shí)驗(yàn)，驗(yàn)證 Microlab PuriFY自動(dòng)化純化系統(tǒng)的應(yīng)用價(jià)值。

二、實(shí)驗(yàn)方案：自動(dòng)化VS手工，同臺(tái)對(duì)比

實(shí)驗(yàn)選取7株細(xì)菌分離株，采用QIAgen試劑盒提取基因組DNA，搭配Quantabio sparQ系列試劑盒構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)，分別設(shè)置手工純化組與Microlab PuriFY自動(dòng)化純化組，每組設(shè)置重復(fù)樣本與無模板對(duì)照（NTC）。

兩組嚴(yán)格按照對(duì)應(yīng)流程完成兩輪磁珠純化，從操作時(shí)長(zhǎng)、耗材用量、核酸濃度純度、文庫(kù)片段、測(cè)序數(shù)據(jù)五大維度開展綜合評(píng)估。

依托MagPore技術(shù)（雙磁鐵系統(tǒng)+正壓驅(qū)動(dòng)+專用純化條），自動(dòng)化系統(tǒng)可高效完成上清轉(zhuǎn)移、多次洗滌、核酸重懸與洗脫收集，大幅簡(jiǎn)化流程。

三、硬核實(shí)測(cè)：多項(xiàng)數(shù)據(jù)優(yōu)秀

1. 人力&耗材大減負(fù)，降本增效看得見

兩輪純化累計(jì)耗時(shí)對(duì)比：

手工操作：總計(jì)50分鐘

Microlab PuriFY：總計(jì)16分鐘

人工操作時(shí)長(zhǎng)縮減3.1倍，科研人員從重復(fù)機(jī)械操作中解放。

耗材消耗對(duì)比：

手工操作：總計(jì)使用79支吸頭

Microlab PuriFY：總計(jì)使用18支吸頭

吸頭用量減少4.4倍，有效降低實(shí)驗(yàn)耗材成本。

2. 文庫(kù)質(zhì)量穩(wěn)定，片段完整性優(yōu)異

通過Qubit、NanoDrop、Agilent TapeStation多重質(zhì)控檢測(cè)：

核酸純度：兩組260/280、260/230吸光比值均處于合格區(qū)間，純度表現(xiàn)相當(dāng)；

文庫(kù)濃度：自動(dòng)化組濃度均一性更強(qiáng)，數(shù)據(jù)波動(dòng)更小；

片段長(zhǎng)度：手工組平均357.4bp，自動(dòng)化組平均393.7bp，文庫(kù)完整性更佳，片段分布符合測(cè)序要求。

同時(shí)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)，手工流程易出現(xiàn)磁珠殘留，而Microlab PuriFY全程無磁珠攜帶污染，規(guī)避了雜質(zhì)對(duì)后續(xù)實(shí)驗(yàn)的干擾。平臺(tái)還具備自動(dòng)排障能力，遇到管路堵塞可自動(dòng)加壓疏通，實(shí)驗(yàn)容錯(cuò)率更高。

3. 測(cè)序表現(xiàn)跨越式提升，測(cè)序深度達(dá)標(biāo)無憂

采用Illumina MiSeq開展上機(jī)測(cè)序，核心數(shù)據(jù)差距顯著：

測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)量：自動(dòng)化組數(shù)據(jù)產(chǎn)出約為手工組的3倍，讀段數(shù)量大幅提升；

基因組覆蓋深度：手工樣本中位覆蓋深度僅25~33×，自動(dòng)化樣本可達(dá) 65~73×，輕松突破傳統(tǒng)方法瓶頸，穩(wěn)定實(shí)現(xiàn)＞40×的理想測(cè)序深度；

測(cè)序質(zhì)量：兩組Q30優(yōu)質(zhì)讀占比基本持平，測(cè)序堿基可靠性均有保障。

充足的數(shù)據(jù)產(chǎn)出與更高的覆蓋深度，讓細(xì)菌基因組分析結(jié)果更精準(zhǔn)、更全面。

四、平臺(tái)核心優(yōu)勢(shì)，適配臨床&科研實(shí)驗(yàn)室

操作簡(jiǎn)單易上手：程序編寫、修改、運(yùn)行門檻低，快速落地現(xiàn)有實(shí)驗(yàn)體系；

設(shè)備布局靈活：機(jī)身占地面積小，搭配定制化觸控屏幕，適配各類實(shí)驗(yàn)室空間；

流程高度兼容：匹配主流NGS文庫(kù)制備試劑盒，通用度廣；

專業(yè)技術(shù)支持：原廠配套服務(wù)，保障實(shí)驗(yàn)穩(wěn)定運(yùn)行。

五、總結(jié)

從人力成本、耗材消耗，到文庫(kù)質(zhì)控、上機(jī)測(cè)序，Hamilton Microlab PuriFY自動(dòng)化DNA純化系統(tǒng)全面優(yōu)于傳統(tǒng)手工操作。它不僅解決了細(xì)菌全基因組測(cè)序文庫(kù)純化的人工痛點(diǎn)，更顯著提升測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量與實(shí)驗(yàn)重復(fù)性，是高通量NGS實(shí)驗(yàn)室提質(zhì)增效的理想選擇。

無論是基礎(chǔ)科研、病原微生物檢測(cè)，還是規(guī)模化樣本測(cè)序項(xiàng)目，這款自動(dòng)化平臺(tái)都能為您的實(shí)驗(yàn)保駕護(hù)航！